植物的替代控制：利用柠檬桉、皇竹草、臂形草、红三叶草、狗牙根等植物进行替代控制有一定成效等，作为替代植物来抑制紫茎泽兰的生长。
生物防除：利用泽兰实蝇、旋皮天牛和某些真菌有效控制紫茎泽兰的生长。泽兰实蝇对植株生长有明显的抑制作用，野外寄生率可达50%以上。泽兰实蝇属双翅目，实蝇科，具有专一寄生紫茎泽兰的特性，卵产在紫茎泽兰生长点上，孵化后即蛀入幼嫩部分取食，幼虫长大后形成虫瘿，阻碍紫茎泽兰的生长繁殖，削弱大面积传播危害；旋皮天牛在紫茎泽兰根颈部钻孔取食，造成机械损伤而致全株死亡；泽兰尾孢菌、飞机草链格孢菌、飞机草绒孢菌、叶斑真菌等可以引起紫茎泽兰叶斑病，造成叶子被侵染，失绿，生长受阻。 农田作物种植前，每亩田用41%草甘膦异丙胺盐水剂360-400克，兑水40-60千克，均匀喷雾；松林每亩用70%嘧磺隆可溶性粉剂15-30克，兑水40-60千克，均匀喷雾；荒坡、公路沿线等，每亩用24%毒莠定水剂200-350克，兑水40-60千克，均匀喷雾；草地、果园中的紫茎泽兰用草甘膦进行防治，慎用甲嘧磺隆。
2,4-D、草甘膦、敌草快、麦草畏等10多种除草剂对紫茎泽兰地上部分有一定的控制作用，但对其根部防治效果较差。
化学防治时，选择晴朗天气，雾滴不要漂移到作物上，同时在施药区插上警示牌，避免造成人、畜中毒或其他意外。