为确保高起点建设优势，经上级主管部门批准，哈尔滨音乐学院将以团队整体划拨的方式，设置音乐与舞蹈学、艺术学理论2个一级学科博士点和音乐与舞蹈学博士后流动站，设置音乐与舞蹈学、艺术学理论2个一级学科硕士点和1个艺术硕士（FMA）专业硕士点，从而成为全国为数不多的拥有2个一级学科博士点的音乐院校。在此学科体系下，学院设置音乐学、作曲与作曲技术理论、音乐表演3个本科专业，下设37个培养方向；设置音乐学系、作曲系、声乐歌剧系、民族声乐系、管弦系、民乐系、钢琴系7个本科教学单位；重点建设音乐与舞蹈学省级重点学科和音乐表演省级重点专业、省领军人才梯队，全面促进学科专业发展。