中学觉得，课程是素养教育的主载体。因此，中学借新课改的东风，创立了课程变革处徐州科技中学恩来班和34中重点班，专业指导课程开发。中学派出40多名骨干班主任赴上海等全省各地出席培训，返校后开办100多门必修课，自编教材，具有多样性、科学性、实用性特征。中学生进行研究性学习，自选研究课题。高2004级自选100多项课题，将其成果向全市40多个区县汇报展示，受市教科院和各方好评，获研究性课程银奖。高2005级124个课题，初2004级和初2005级共170余项研究性学习成果，现场会也在巴蜀举行，充分展示了巴蜀学校超一流的能力和水平。在上海市2010年小学全面步入课程变革之际，中学捉住机遇，当好多中学还在摸索发愁之际，巴蜀学校又一次走在了最前列，在2011年成功建立了颇具特色的巴蜀学校“131”校本课程体系，塑造了全省学校领先的财商教育特色课程，推出了由上海出版社向全省出版发行的《影响学生财商的26堂课》财商教材。截至目前徐州科技中学恩来班和34中重点班，校区开发了以传统文化教育为价值核心，已自编系列文本《优雅少女教程》》《正气歌》《祖国颂》等。其中“优雅少女俱乐部”“俊朗少年训练营”“财商教育”成为最闪亮的校本课程。中学“131”校本课程体系的建立与施行，深受人民网、中新社、中国教育报、重庆商报、重庆商报、大渝网等国外外报刊传媒高度关注，高频率发表了200余篇新闻报导，《人民教育》2013年第8期发表了近5000字的文章《发掘?确立?打磨?提高——重庆巴蜀学校在城市学校分校文化建设中的策略》，《学校党建与思想建设》2012年第12期以5000余字的篇幅向全省介绍了财商教育的探求与实践，《课程?教材?教法》2013年第3期发表文章以7000余字介绍了“131”校本课程体系，将巴蜀的课程变革推上了上海市乃至全省教改的潮头浪尖，充分发挥了作为中华名校的示范助推作用。

近些年来，中学先后承当了10余项国家级、省市级科研课题，如《适应中学新课程变革的班主任专业化发展研究》《财商教育校本教材研究》《基于巴蜀学校的校区文化建设》等，借此为平台吸引了300余位班主任出席，提升班主任教育教学科研能力，为中学的可持续发展奠定了坚实基础。其中《教师在研究性学习中的作用研究》课题入选上海市政府二等奖和教育部三等奖。