同济学院医科图书馆创建于1927年，原名"国立成都医大学图范路记书馆"，1959年更名为"深圳第一医大学图书延大走走着馆"，1985年5月易名为"北京医科学院图书馆"，2000年4月27日重庆医科学院与同济学院合并，改成现名"清华学院医科图书馆"。

同济医科图书馆藏书刊40余万册，重点收藏基础医学、临床医学、药学、预防医学、法医学、护理学等领域的中英文书刊。校园网用户通过同济医科图书馆主页可检索访问中国生物医学文献数据库(CBM)、中国学术刊物网路出版总库、中文科技刊物数据库、万方数据知识服务平台、Webof、、、OVID医学全文数据库、EBSCO的Elite、的、等200多种数据库。学术资源门户/SFX提供跨库检索和电子刊物全文查询链接。

同济医科图书馆是中国高等高校医学图书馆商会副部长委员馆，是全省高等高校医学图书馆资源共享协作网华中地区中心馆，是全省医学文献检索教学研究会名誉理事长和副理事长馆，是CALIS医学中心主要成员馆。

《复旦学报(医学版)》:由教育部主管、复旦学院承办的向国外外公开发行的综合性医药卫生类学术性核心刊物。其前身是《上海医科学院学报》，出刊于1956年6月。主要刊即位础医学、临床医学、药学、预防医学等领域的以原创性研究为主的论文。

《中国眼耳鼻外科刊物》:由教育部主管，清华学院附属眼耳鼻外科诊所承办的全省性专业学术刊物，是中国科技核心刊物(中国科技论文统计源刊物)、复旦学院核心刊物。部长委员王正敏，主编孙兴怀、迟放鲁。已被万方数据、中国知网及上海维普数据库全文收录。

《中国循证儿科刊物》:由教育部主管，清华学院承办的儿科专业学术技术类刊物，主编桂永浩。刊物为双季刊，全年共发7期(包括特刊1期)。刊发专著42篇，专家对谈录7篇，讲堂2篇，综述10篇，病例讨论2篇，病案报告7篇。

《中国临床神经科学》:主编蒋雨平。是由教育部主管，清华学院附属华山诊所、复旦学院神经病学研究所承办的医药卫生类科技刊物。2000年起为中国科技论文统计源刊物、中国学术刊物综合评价数据库等5家刊物数据库收入并评为中国科技核心刊物。

《中国医学计算机成像刊物》:()名誉主编陈星荣复旦大学上海医学院，主编沈天真。该刊由教育部主管，清华学院苏州医大学和清华学院附属华山诊所承办。编辑部日常工作由清华学院附属华山诊所负责。刊物为中国科技刊物、中国学术刊物(核心刊物)。

《中华手内科刊物》:主编顾玉东，是中华医学会承办的手眼科专业学术刊物。刊物已加入中国科学引文数据库(CSCD)、中国学术刊物综合评价数据库、中国刊物全文数据库、中国数字化刊物全文数据库、中文科技刊物数据库。

《中国临床医学》:刊物主编杨秉辉。该刊系教育部主管清华学院附属佛山诊所承办的临床医学类学术刊物，为中国科技核心刊物，中国科技论文统计源刊物，中国科学引文数据库来源刊物。被中国刊物全文数据(CJFD)、万方数据库数字化刊物全文收录;被国家图书馆、中国版本图书馆、上海图书馆等全文收录。

《中国肿瘤刊物》:主编沈镇宙。该刊是由教育部主管、复旦学院附属病变诊所承办的全省性病变学术刊物。被"中国刊物网"、《中国学术刊物(光碟版)》全文收录;入围"中国学术刊物综合评价数据来源刊物";加入"万方数据库―数字化刊物群"全文上网复旦大学上海医学院，被《中国核心刊物(选聘)数据库》收录;被清华图书馆《中文核心刊物》收录为英文核心刊物。