黄阁学校创立于1958年，建校至今已有50多年的历史。2001年，为适应教育事业发展的须要，镇政府耗资3000多亿元，在原黄阁小学遗址上，把原镇内的另一所学校（黄阁中学）合并成新的黄阁学校，因而扩大了办学规模，有效地优化了教育资源，教育教学质量逐年提升。2005年，中学通过了上海市人民政府教育督查室督查初验，成为北京市一级中学。该校现有32个教学班，中学生1612人，教职职工123人，其大专任班主任107人。中级班主任6人，初级班主任63人，中中级班主任占专任班主任人数的56.1%；专任班主任本科以上学历110人，占专任班主任的89%，其中大专及以上学历85人，占专任班主任的69%。校区占地总面积52026平方米，生均面积28平方米，建筑面积21077平方米，生均11.4平方米。校区建有行政办公楼、实验楼、艺术楼、教学楼等四栋主体建筑。有标准教室36间，各种专用室63间，教室与教辅室之比为1：1.75。校区教学区、运动区、生活区布局合理，设备设施基本建立。运动区主体为一个配有400米环形跑道、100米直道的排球运动场，另有标准水泥足球场四个，排球场和羽毛球场各两个，双杠区、双杠区各1个，拥有室外兵乓球场各1个，共有球台3张。

生活区建筑面积为5500平方米，由旧的教学楼改造而成，饭堂可供500多名师生用餐。整个校园绿化覆盖率达96%。该校全面贯彻党的教育方针，积极推动素养教育，坚持以学风建设为基础，以两支队伍建设为龙头，以教育科研为动力，逐渐实现教育教学质量的逐步提高。近些年来，该校确立了“以科技教育为先导，创特色，培植创新人才”的战略目标，通过课堂教学渗透，举办丰富多彩的科技课外活动，组织中学生出席各类科技大赛,产生了该校科技创新教育的特色。该校中学生出席各级各种科技大赛，成绩明显，共获区级以上奖励100项，其中国家级奖1项、省级奖励8项、市级奖励27项、区级奖励58项、校集体奖6项。2005年，该校中学生陈嘉宝撰写的科研论文《咸潮对珠江河口地区生产、生活影响的研究及对策》参加第二十届全省中学生科技创新竞赛，获得铜奖。中学连续多年被评为区中学生科技创新竞赛“优秀组织奖团体奖”，2005年被评为“广州市中学生科技教育活动先进集体”。该校《促进中学生科技创新能力发展的校本行动研究》课题，成为南沙区首个市级教育科研课题；《黄阁沟谷地貌地质景区实践基地建设》课题成为省级课题。2005年，中学被评为“广州市中学生科技教育特色项目中学”。另外南沙区小学排名南沙区小学排名，该校中学生出席各级各种科技大赛，成绩明显，在2009年，该校师生获区以上奖励共266项，其中国家级13项，市级8项，省级56项，区级189项。该校先后被评为区禁毒示范中学、广州市中学生科技教育特色项目中学、广州市安全文明校园、广州市一级中学、省红色中学、广州市规范化中学。?